Se funda en 1989 como una iniciativa llevada a cabo por la Asociación de Vecinos del Barrio de San Bernardo y materializada alrededor de la Parroquia de San Juan de Mata. Tras descartarse varias denominaciones se opta por llamarse Hermandad del Vía Crucis al entender que la Semana Santa de Salamanca carecía de una cofradía de este tipo. La primera Junta General de la Hermandad se reúne a primeros del año 1990 y se elige la primera Junta Directiva que rápidamente se pone manos a la obra con la intención de sacar el desfile a la calle esa misma Semana Santa. En pocas semanas, se consigue una talla realizada en los talleres de Olot que es bendecida el 31 de marzo, pocos días antes de su salida prevista el siguiente Jueves Santo. Pese a lo escaso del tiempo disponible, la Hermandad consigue hacerse con los enseres necesarios para que su primera salida pudiera hacerse con la mínima dignidad requerida. Así, a las 7,30 del día 12 de abril de 1990, salía a la calle por vez primera, la procesión del Vía Crucis. Tras unos años saliendo a primeras horas de la mañana del Jueves Santo, la procesión traslada la hora de salida a media tarde haciendo recorridos similares hasta que en el año 2022 cambia su lugar de inicio, sustituyendo la iglesia de San Juan de Mata por la Catedral Nueva, para dirigirse a su sede canónica en el Barrio de San Bernardo.
JESÚS DEL VÍA CRUCIS El primer paso de la Hermandad fue encargado al taller de escultura religiosa de Olot. La idea de la imagen estuvo inspirada en un Ecce Homo que se encuentra en la Catedral de Palencia de la Escuela de Gil de Siloé. Sin embargo las intenciones de salir a la calle lo antes posible no da lugar a largas esperas y finalmente se opta por elegir un modelo estandarizado de los existentes en cartera del citado taller gerundense. La talla desfila unos años, sin embargo, conocedores de la escasa calidad artística de la imagen y los desperfectos que se habían ido produciendo, los responsables de la Hermandad comienzan a perfilar la idea de encargar una nueva talla que, aunque copie el estilo de la ya existente, mejore su calidad y su valor artístico. Se encarga la tarea, con la mediación del Ayuntamiento de Salamanca, al artista salmantino Antonio Malmierca Zúñiga que realiza la talla en madera de cedro siguiendo las pautas tradicionales de la imaginería religiosa clásica. Representa la imagen de Jesús maniatado después de haber sido azotado, coronado de espinas y vestido con clámide púrpura. La antigua imagen utilizada los primeros años de los desfiles procesionales de la Hermandad, se encuentra en la Iglesia del Hospital de la Santísima Trinidad adonde acude cada Jueves Santo la procesión del Via Crucis a realizar un sencillo y emotivo acto. La nueva imagen es bendecida el 11 de marzo de 2007 y desfila por primera vez el Jueves Santo de aquel mismo año, 5 de abril. LA SANTA CRUZ DESNUDA Para dar cabida a los más jóvenes integrantes de la Hermandad, el paso de la Santa Cruz Desnuda desfila en la salida penitencial de cada Jueves Santo. Es una paso cuyo motivo principal es una cruz de madera vacía de la que cuelga el lienzo de descendimiento y sobre la que se apoyan las escaleras y dos lanzas que forman una V en la cruz: la de Longinos y la de Estefatón. El conjunto se asienta sobre el Gólgota con la tradicional calavera de Adán. Es portado a hombros por 16 niños en unas andas de madera tallada.
